En el ámbito de su competencia, el INAP a través del CEMUNI busca generar en los gobiernos locales procesos permanentes de formación, capacitación y modernización institucional, con el fin de incrementar sus capacidades de gestión y gobernanza democrática. Este Programa se implementa en el marco de la Mesa Interinstitucional de Fortalecimiento Municipal que lidera el Instituto de Fomento Municipal (INFOM). El CEMUNI funciona a partir de acuerdos de cooperación entre diferentes entidades relacionadas con la gestión municipal.